广东省2株白喉棒状杆菌的鉴定与分析

摘要：

目的:对广东省2株
C. diphtheriae白喉棒状杆菌进行精准鉴定与分析。
方法:通过API Coryne棒状杆菌生化卡对2010年广州和2020年珠海分离的
C. diphtheriae进行生化及质谱鉴定；利用Illumina平台进行测序，CLC软件拼接，JSpeciesWS线上工具进行平均核苷酸同源性识别；BLASTN进行
narKGHIJ和
tox基因检测，使用MEGA-X构建wgSNP系统发育进化树。
结果:GD-Guangzhou-2010为Belfanti型，GD-Zhuhai-2020为Gravis型。棒状杆菌种间ANI值计算结果显示，GD-Guangzhou-2010与
C.belfantii间ANIb=99.61%，GD-Zhuhai-2020与
C. diphtheriae间ANIb=97.64%。BLASTN结果显示，GD-Guangzhou-2010硝酸盐还原基因
narKGHIJ均为阴性且未携带
tox基因，GD-Zhuhai-2020硝酸盐还原基因
narKGHIJ均为阳性，未携带
tox基因。
C. diphtheriae的wgSNP进化树显示两个主要进化分支，第一个分支包含所有Mitis型和Gravis型以及GD-Zhuhai-2020，第二个分支包含所有的
C.belfantii、
C.diphtheriae subsp.
lausannense分离株及GD-Guangzhou-2010。
结论:广东省成功分离鉴定出两株非产毒性
C. diphtheriae，系统发生树提示GD-Guangzhou-2010和GD-Zhuhai-2020位于两个不同的进化分支。

关键词：白喉棒状杆菌、全基因组测序、wgSNP进化树、鉴定

所属期刊栏目：56

资助基金：广东省科技计划项目2021B1212030007;Science and Technology Planning Project of Guangdong Province2021B1212030007

在线出版日期：2023-05-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：427-432