宏基因组二代测序在获得性免疫缺陷综合征合并中枢神经系统感染中的临床应用

摘要：

目的:评价脑脊液宏基因组二代测序（mNGS）在获得性免疫缺陷综合征（AIDS）患者合并中枢神经系统（CNS）感染诊断中的临床应用价值，了解AIDS患者合并CNS感染的病原谱。方法:收集2021年1月至2022年8月于武汉大学中南医院收治并诊断为AIDS合并CNS感染者的临床资料、mNGS与常规病原检测法检出的病原体信息。比较常规病原学检测与mNGS检出病原体情况，与临床诊断进行一致性评价。结果:61例诊断为AIDS合并CNS感染者中，经mNGS联合常规病原学检测后60例（98.4%、60/61）患者明确病原学诊断，与单独常规病原学检测阳性率（49.2%、30/61）以及单独mNGS阳性率（83.6%、51/61）差异均具有统计学意义（χ2 = 38.125、P < 0.001，χ2 = 8.093、P = 0.004）。mNGS阳性患者51例（83.6%），高于常规病原体检测阳性30例（49.2%），差异具有统计学意义（χ2 = 16.201、P < 0.001）。其中mNGS方法结果中两种及以上的病原体同时检出率为41.0%（25/61），高于常规病原检测法[9.8%（6/61）]，差异具有统计学意义（χ2 = 15.612、P < 0.001）。在隐球菌脑膜炎检出率中，常规检测方法[14.8%（9/61）]与mNGS检测方法[13.1%（8/61）]具有良好一致性，其中前者与临床诊断的一致性为90%（9/10），后者为80%（8/10）；43例（70.5%）患者至少检出1种病毒，其中24例（39.3%）患者检出人疱疹病毒4型（EB病毒），15例（24.6%）患者检出人疱疹病毒5型（CMV），8例（13.1%）患者检出JC多瘤病毒。14例（23.0%）患者中共检出18株真菌，包括新型隐球菌8株、似平滑念珠菌3株、曲霉菌4株、马尔尼菲篮状菌、耶氏肺胞子菌及尖端赛多孢子菌各1株；非典型病原体8例（13.1%），包括刚地弓形虫3例、苍白密螺旋体3例、军团菌、猫立克次体各1例；结核及非结核分支杆菌各2例（6.6%）。61例患者中，3例死亡，病死率为4.9%（3/61）。结论:AIDS晚期患者合并CNS感染中混合感染常见，病原谱依次包括病毒、真菌、细菌和非典型病原体等。mNGS联合常规病原学检测可显著提高颅内感染的病原检出率，有助于及时精准诊疗，提高患者生存率。

关键词：宏基因组二代测序、获得性免疫缺陷综合征、人类免疫缺陷病毒、病原学检测、中枢神经系统感染、病原谱

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资助基金：2020年湖北省重点研发计划项目No. 2020BCB025;武汉大学中南医院学科培育项目No. ZNXKPY2021021

在线出版日期：2023-04-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：24-31