外周血单个核细胞内人类免疫缺陷病毒DNA和RNA定量对病毒转录活性的区分

摘要：

目的 基于人类免疫缺陷病毒Ⅰ型(HIV-1)感染者外周血单个核细胞(PBMCs)中HIV-1总DNA和RNA定量检测结果对感染细胞内病毒的转录活性进行区分.方法 采集2017年10月至2018年12月于哈尔滨医科大学附属第四医院感染科就诊的HIV-1感染者血液样本,分离PBMCs细胞,采用PCR荧光探针法对PBMCs细胞内HIV-1总DNA和RNA进行定量检测,并计算两者比值(Ratio).根据Ratio值筛选出HIV-1转录活跃组样本和相对非活跃组样本,另外选择健康人PBMCs样本作为对照组.对3组样本进行基因转录组表达谱检测以及人口特征差异性检验,并对基因表达谱检测结果进行主成分分析以验证对3组样本病毒转录活性区分的准确性.结果 从60例感染HIV-1患者的PBMCs样本中筛选出HIV-1转录活跃组样本(10例)和相对非活跃组样本(11例),另外选择6例健康人PBMCs样本作为对照组.其中转录活跃组样本Ratio值为165.2～738.93,平均为(339.27±189.68);相对非活跃组Ratio值为4.67～42.39,平均为(17.65±11.78).转录活跃组和相对非活跃组样本间的CD4+T细胞计数(P=0.049)和Ratio值(P＜0.001)差异均具有统计学意义;3组样本年龄(P=0.989)和性别(P=0.650)分布差异无统计学意义.对3组样本的PBMCs基因表达谱主成分分析结果显示:对照组与HIV-1感染者(包括转录活跃组和相对非活跃组)间区分明显.转录活跃组和相对非活跃组间有部分样本重合,同时结果也显示当HIV-1感染者的CD4+T淋巴细胞计数与健康人无显著差异时,其细胞内的基因表达与健康人接近.结论 基于HIV-1总DNA和RNA定量检测结果及两者间比值可以较好地区分PBMCs内病毒转录活性.HIV-1感染细胞内部病毒的不同转录激活状况可导致其基因表达谱的异质性.

关键词：人类免疫缺陷病毒、脱氧核糖核酸、核糖核酸、外周血单个核细胞、基因表达谱、转录激活

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分类号：R512.62;TP391;R736.1

资助基金：国家自然科学基金;国家自然科学基金;吉林省科技发展计划优秀青年人才基金项目;吉林省卫生与健康青年科技骨干培养计划;吉林省教育厅十三五科学技术项目;吉林省大学生创新创业训练计划项目

在线出版日期：2022-09-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：165-171