宏基因组二代测序在鲍曼不动杆菌肺炎混合感染者诊疗中的应用

摘要：

目的:探讨宏基因组二代测序（mNGS）技术对重症监护病房鲍曼不动杆菌肺炎混合感染者诊疗的应用价值。方法:回顾性收集扬州大学附属医院2019年1月至2021年5月同时行肺泡灌洗液mNGS技术和传统病原检测的84例肺炎患者的基本资料、细菌培养以及mNGS检测结果、抗菌药物应用等。根据鲍曼不动杆菌感染的诊断标准和mNGS检测结果，将入组患者分为定植菌组（25例）、单一感染组（29例）和混合感染组（30例）。炎性指标、辛普森菌群多样性指数（SDI）、抗菌药物使用时间、使用强度、费用和总药费为正态分布的计量资料，采用t检验或ANOVA检验分析；患者年龄分布、基础疾病、发热时间分布、不同临床疗效和治疗转归占比均采用[例（%）]表示，组间比较采用卡方检验。结果:入组的84例患者传统病原和mNGS检测鲍曼不动杆菌均为阳性，其中25例鲍曼不动杆菌定植和59例鲍曼不动杆菌肺炎患者；男性44例、女性40例，年龄[65.4（62，68）]岁。mNGS检测中，30例[50.85%（30/59）]检出混合感染；传统病原检测中，3例[5.08%（3/59）]检出混合感染，显著低于mNGS检测，差异有统计学意义（χ2 = 30.667、P < 0.001）。mNGS检出混合感染居前3位的病原体分别为人疱疹病毒（7例）、肺炎链球菌（5例）和耶氏肺孢子虫（5例）。定植菌组、单一感染组和混合感染组患者SDI分别为（0.77 ± 0.11）、（0.38 ± 0.16）和（0.34 ± 0.17），差异具有统计学意义（F = 65.411、P < 0.001）。单一感染组与混合感染组患者白细胞计数（t = 2.211、P = 0.031）、中性粒细胞比率（t = 2.068、P = 0.043）、C-反应蛋白（t = 2.024、P = 0.048）、抗菌药物费用（t = 2.279、P = 0.026）、抗菌药物使用强度（t = 2.161、P = 0.035）、住院天数（t = 2.664、P = 0.010）、总药费（t = 2.397、P = 0.020）和体温降至正常时间（t =-2.178、P = 0.034）]差异均有统计学意义。单一感染组患者治疗显效率高于混合感染组（82.76% vs. 56.67%，χ2 = 4.735、P = 0.047）。结论:肺泡灌洗液mNGS技术在检测鲍曼不动杆菌肺炎混合感染方面优势明显，能够辅助临床优选抗菌药物，促进患者康复。

关键词：宏基因组二代测序、肺炎、支气管肺泡灌洗液、鲍曼不动杆菌、混合感染

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资助基金：江苏省药学会-恒瑞药学服务专项科研资助项目No. H202129;江苏省药学会-天晴医院药学科研项目No. Q202050

在线出版日期：2022-07-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：115-121