二代测序技术应用于脑脊液检测在结核性脑膜炎中的早期诊断价值

摘要：

目的 评价二代测序技术应用于脑脊液检测在结核性脑膜炎(TBM)患者中的早期诊断价值.方法 前瞻性纳入2018年2月2日至2018年8月2日于山东省胸科医院就诊的临床怀疑TBM的患者共50例,并跟踪随访其诊疗结局.送检脑脊液标本均进行二代测序,测序所得原始序列与病原微生物数据库进行对比得到最终结果.二代测序结果以检测到结核分枝杆菌复合群唯一比对序列为阳性,未检测到唯一比对序列为阴性.以符合脑脊液结核分枝杆菌培养阳性、涂片阳性、Xpert MTB/RIF检测阳性及结核分枝杆菌核酸检测阳性等4项中至少1项即为确诊TBM患者;临床可疑TBM且抗结核治疗有效为临床诊断患者;有其他病原学依据或临床排除TBM者为非TBM患者.分析二代测序在TBM早期诊断中的敏感性和特异度.结果 确诊为TBM患者22例中Xpert MTB/RIF检测阳性13例,培养阳性6例,结核分枝杆菌核酸PCR检测阳性5例,临床诊断为TBM患者12例,非TBM患者16例.在确诊及临床诊断患者中,二代测序技术检测到结核分枝杆菌复合群系列20例,敏感性为58.8％(20/34),特异度为100％(16/16).在确诊患者中,二代测序的敏感性为63.6％(14/22);在同步进行结核分枝杆菌培养、Xpert MTB/RIF检测与二代测序的50例标本中,以临床诊断为标准,3种方法的特异度均为100％(16/16);传统方法、Xpert MTB/RIF检测及二代测序的敏感性分别为29.4％(10/34)、38.2(13/24)和58.8(20/34),前两种检测方法与二代测序敏感性差异均有统计学意义(McNemar检验:χ2=8.333、P=0.013,χ2=8.333、P=0.065).传统方法与二代测序联合检测的敏感性高达82.4％(28/34).结论 二代测序技术能够较快速地检测脑脊液中的结核分枝杆菌复合群,且其敏感性和特异度均较高,可作为TBM的早期诊断指标.二代测序联合传统检测方法可提高检出率.

关键词：高通量核苷酸测序、结核性脑膜炎、脑脊液、诊断、二代测序

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资助基金：山东省医药卫生科技发展计划项目No. 2019WS527

在线出版日期：2020-09-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：291-295