Pax2基因异常参与孤独症谱系障碍发病的生物信息学分析

摘要：

目的:对配对盒2(
Pax2)相关孤独症谱系障碍(ASD)易感基因进行生物信息学分析，探讨
Pax2基因参与ASD发病的可能机制。
方法:(1)将Pathway Commons数据库中与
Pax2基因相关的基因(606个)和Simons基金会孤独症研究计划(SFARI)数据库中ASD易感基因(1 023个)取交集得到65个
Pax2基因相关ASD易感基因。在基因功能分析网站Metascape对
Pax2基因相关ASD易感基因进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组数据库(KEGG)通路富集分析。使用Cytoscape软件cytoHubba插件的最大团中心度(MCC)算法，筛选前10个核心
Pax2基因相关ASD易感基因。(2)取3只13周龄雄性Pax2-nestin小鼠(实验组)及3只同龄雄性C57 BL/6J小鼠(对照组)，采用Western blotting实验检测2组小鼠海马组织中谷氨酸受体2B亚基(GluN2B)蛋白的表达。
结果:(1)GO分析显示
Pax2基因相关ASD易感基因在生物学过程(BP)本体主要富集于跨突触信号、行为、脑发育、化学突触传递的调节、胶质细胞再生、小脑形态发育、谷氨酸能突触传递、记忆等子集，在细胞组分(CC)本体主要富集于突触后、树突、β连环蛋白-T细胞因子(TCF)复合物、树突分支等子集，在分子功能(MF)本体主要富集于突触后密度蛋白95/果蝇圆盘大肿瘤抑制蛋白/紧密连接带-1蛋白(PDZ)结合结构域、转录因子结合、跨膜受体蛋白酪氨酸激酶活性、谷氨酸受体活性、微管蛋白结合等子集。KEGG通路富集分析显示
Pax2基因相关ASD易感基因主要分布在丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、长时程抑制、谷氨酸能突触等通路。核心
Pax2基因相关ASD易感基因为
Gria1、
Dlg2、
Ntrk2、
Grid2、
Igf1、
Jmjd1c、
Ldb1、
Tcf4、
Tcf7l2、
Adrb2。(2)Western blotting实验显示，对照组、实验组小鼠海马组织中GluN2B蛋白的相对表达量分别为2.36±0.60、0.85±0.44，差异有统计学意义(
P<0.05)。
结论:Pax2基因异常可能导致
Pax2基因相关ASD易感基因的表达或功能异常，并通过多种机制参与ASD的发病。

关键词：孤独症谱系障碍、配对盒2基因、生物信息学、发病机制

所属期刊栏目：22

资助基金：山西省应用基础研究项目201801D211010;Applied Basic Research Project of Shanxi Province201801D211010

在线出版日期：2023-05-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：333-339