肿瘤分化相关蛋白HIV-ep2/MIBP1/MBP2的结构及功能分析

摘要：

目的 预测和分析肿瘤分化相关蛋白HIV-ep2/MIBP1/MBP2的结构及功能. 方法检索蛋白质全序列,应用所克隆的基因片段序列Genebank数据库中进行BLUST比对,得出HIV-ep2/MIBP1的全长序列.应用ExPASy提供的ProtParam程序对该蛋白质进行基本特征进行运算,进一步进行二级结构分析.SMART预测功能域,PDB网站模拟三维结构,ELM预测基元.蛋白质亚细胞定位的信息学预测;Source资源网站作组织表达分布.结果 HIV-ep2/MIBP1/MBP2基因编码一个含有2500氨基酸的巨大蛋白质,属于不稳定蛋白.二级结构主要包括62.52%随机卷曲;22.36%α螺旋;10.32%伸展链;4.80%β转角.三级结构主要含有4个锌指结构,计算机预测了蛋白的三维立体结构,可能的基元46种.功能方面该蛋白定位于细胞核,在滤泡淋巴瘤、肾近曲小管、大脑尾状核、精神分裂症脑S-11额叶、全脑、丘脑中含量丰富.结论 HIV-ep2/MIBP1/MBP2蛋白为一个2500氨基酸的巨大蛋白,主要结构为4个锌指,定位于细胞核,可能与cyclin系统、Src家族等有关.

关键词：HIV-ep2/MIBP1/MBP2、蛋白质、结构、功能、生物信息学

所属期刊栏目：22

分类号：R73(肿瘤学)

资助基金：天津市科委应用基础研究重点基金03380091

在线出版日期：2006-12-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：702-705