2011-2015年安阳地区手足口病相关柯萨奇病毒A6 VP1基因特征

摘要：

目的 对2011-2015年安阳地区手足口病(HFMD)相关柯萨奇病毒A6(CVA6)VP1基因进行研究,以了解本地区CV-A6的分子流行病学特征.方法 使用实时荧光PCR方法对临床病例标本进行肠道病毒型别鉴定.设计引物对CV-A6阳性标本的VP1区进行扩增和测序.构建系统进化树并进行系统进化分析.对近年流行的CVA6中国毒株的VP1基因进行进化选择压力分析.结果 2011-2015年安阳地区检出CV-A6阳性标本365份,占总肠道病毒阳性标本的比例为19.59%.系统进化分析显示,抽样调查的22条安阳地区CVA6 VP1序列中,有5条属于D1基因亚型,另外17条属于D2基因亚型.进化选择压力分析显示,D1、D2基因亚型中国株VP1基因承受的进化选择压力(ω值)分别为0.031和0.075;在D1、D2基因亚型中国株VP1基因上分别发现正选择氨基酸位点1处和4处.结论 2011-2015年安阳地区先后流行有D1、D2两种基因亚型的CVA6毒株.D2基因亚型对D1基因亚型的替代以及D2基因亚型的持续传播是造成安阳地区2013-2015年CV-A6型手足口病疫情的主要原因.

关键词：手足口病、肠道病毒属、柯萨奇病毒、基因型

所属期刊栏目：31

分类号：R373.2;R512.91;S852.65

在线出版日期：2017-06-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：113-117