基于TCGA数据库Wnt相关长链非编码RNA构建肾乳头状细胞癌预后模型

摘要：

目的:构建一种Wnt通路相关的长链非编码RNA（LncRNAs）的肾乳头状细胞癌（pRCC）预后模型。方法:经癌症基因组图谱（TCGA）获取pRCC患者的转录组数据和对应的临床信息。采用共表达网络分析、COX回归和Lasso分析方法筛选出Wnt相关的LncRNA用于构建风险预后模型。此外，通过绘制受试者工作特征（ROC）曲线验证模型的预测性能。结果:构建了由5个Wnt相关的LncRNAs（CT66，PRECSIT，AL352984.1，AC124798.1，AC011503.2）组成的肾乳头状细胞癌预后模型。生存分析结果表明，该模型在TCGA训练组（P=0.002）、测试组（P=0.013）和完整组（P<0.001）中均具有较好的有效性。将风险评分作为独立预后指标时，完整组患者5年总生存率的ROC曲线下面积（AUC）为0.708。结论:由5个Wnt相关lncRNA构建的新的预后模型有助于评估pRCC患者的预后。

关键词：Wnt、肾乳头状细胞癌、肾肿瘤、癌症基因组图谱、大数据、生物信息学分析、计算生物学、长链非编码RNA、预后模型

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资助基金：国家自然科学基金81972419，81772753

在线出版日期：2023-05-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：270-275