结直肠癌奥沙利铂耐药关键基因的生物信息学分析及意义

摘要：

目的 筛选与结直肠癌(CRC)中奥沙利铂(OXA)耐药性相关的基因和通路.方法 首先通过GEO数据库分析GSE76092的基因表达谱,筛选出CRC的OXA敏感和OXA耐药细胞系之间的差异表达基因(DEGs).利用DAVID数据库进行基因本体论(Go)分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路分析.通过STRING工具构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络.经MCODE插件选择关键基因,并利用GEPIA工具进行生存分析.最后使用miRWalk数据库预测相关的miRNA.结果 通过数据分析总共获得474个DEGs,并筛选了相关的信号通路和PPI网络.筛选出15个中心基因,其中7个显著参与NF-κB和趋化因子信号等通路.对7个关键基因的生存分析表明,CXCL8、IL-1β和PTGS2表达水平与CRC患者的总体生存相关.预测hsa-miR-6893-5p、hsa-miR-7851-3p和hsa-miR-96-3p是OXA耐药相关核心miRNA.结论 基于生物信息学筛选出来的OXA耐药关键基因和信号通路,为CRC中OXA耐药的潜在机制提供更深入的了解.

关键词：结直肠肿瘤、奥沙利铂、耐药性、生物信息学分析

所属期刊栏目：14

资助基金：国家自然科学基金资助项目;广东省自然科学基金资助项目;广州市科学技术计划项目

在线出版日期：2020-10-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：349-354