10.3760/cma.j.issn.1007-631X.2013.02.012
结直肠癌肝转移相关靶基因转录调控网络的构建及基因本体论功能富集分析
目的 研究结直肠癌肝脏转移微小RNA (miRNA)表达的差异及相关特性,并对结直肠癌肝脏转移miRNA对应的靶基因和生物信息学特征进行针对性分析.方法 收集10例伴有或不伴有肝转移的结直肠癌患者肿瘤组织标本.应用miRNA芯片方法对两组样本的miRNA表达差异情况进行研究,利用软件预测靶基因.进一步构建和分析肝转移结直肠癌相关的miRNA-Target转录调控网络及基因本体论功能模块.结果 芯片结果筛选出6种结直肠癌肝转移组较非转移组表达失调的miRNA(上调的miR-224、miR-1236和miR-622;下调的miR-155、miR-342-5p、miR-363).最显著上调的miR-224不但可以与其对应靶基因行使调控作用,而且可以与其他miRNA协同作用于其下游的靶基因功能团,行使相应功能.结论 miR-224作为调控网络的核心,可同时或异时性调控相关的重要基因功能团,进而完成对结直肠癌肝脏转移的转录后水平操控,在肝转移过程中起重要作用.
结直肠肿瘤、肿瘤转移、微RNAs、基因调控网络
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北京市教委科技计划面上资助项目KM200910025022
2013-04-26(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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