彩色花椰菜叶绿体全基因组特征分析

摘要：

使用 Illumina HiSeq 2500 高通量测序平台测序组装白色、紫色、橙色、淡绿色 4 种花椰菜叶绿体全基因组,分析结果显示,花椰菜叶绿体基因组全长为 153 364 bp(淡绿色)和 153 366 bp(白色、紫色、橙色),由 4 个区域组成,包括 1 个88 136～88 138 bp的长单拷贝区(LSC)、1 个 17 834～17 835 b的短单拷贝区(SSC)以及 2 个 26 196～26 197 bp的反向重复(IRa/IRb),4 种花椰菜叶绿体基因组均注释 132 个基因,包括 87 个蛋白编码基因、37 个 tRNA和 8 个 rRNA.有 19个基因在 IR区重复;平均总 GC 含量均为 36.36％;共有 67 种密码子编码 24 种氨基酸,32 个密码子的使用频率(RSCU)大于 1.00,偏向于以 A或 U结尾的同义密码子占 90.6％,系统发育分析表明,花椰菜和甘蓝亲缘关系最近,它们与芥菜和欧洲油菜聚为一大类.

关键词：花椰菜、叶绿体基因组、密码子偏好性、SSR、系统发育

所属期刊栏目：42

分类号：S651(瓜果园艺)

资助基金：甘肃省科技厅技术创新引导计划22CXZNA002

在线出版日期：2023-06-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：64-71,封3