闭鞘姜叶绿体基因组特征及其系统发育分析

摘要：

以闭鞘姜为试材,利用高通量测序技术对其进行叶绿体基因组测序、组装和注释,获得完整的叶绿体基因组.结果显示,闭鞘姜叶绿体基因组(GenBank No.OK 641589)大小为 167 158 bp,具有典型的四分体结构,包括一个大单拷贝区(LSC,91 239 bp)、一个小单拷贝区(SSC,19 955 bp)和一对反向重复序列(IRa 和 IRb,各 27 982 bp),总 GC 含量为36.3％;叶绿体基因组共编码了 134 个基因,包括 88 个蛋白质编码基因、38 个tRNA基因和 8 个rRNA基因.闭鞘姜叶绿体基因组鉴定出 50 个散在重复序列以及 70 个简单重复序列(SSR),偏好使用 AT 结尾的密码子.系统发育分析表明,闭鞘姜与绿苞闭鞘姜(Costus viridis)的亲缘关系最为密切.

关键词：闭鞘姜、叶绿体基因组、密码子偏好性、重复序列、系统发育分析

所属期刊栏目：42

分类号：S682.1+9(观赏园艺（花卉和观赏树木）)

资助基金：国家自然科学基金;贵州省科技计划项目;贵州省科技计划项目

在线出版日期：2023-06-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：10-17,24,封2