铁皮石斛叶绿体基因组特征与系统发育分析

摘要：

采用Illumina Hiseq平台高通量测序,对药用植物铁皮石斛进行叶绿体全基因组序列测序、注释、组装及结构分析,从NCBI中下载已发表的13个兰科植物以及2个外类群进行系统发育分析.结果表明,全基因组大小为153 508 bp,大单拷贝区域为85 759 bp,小单拷贝区域为14 973 bp,两个反向重复区域为26 419 bp;共注释133个基因,93个蛋白编码基因,32个转运RNA基因以及8个核糖体rRNA基因,GC的含量占总碱基数量的37.51％;共检测到47个长重复序列,63个简单重复序列;系统发育结果与石斛亲缘性最近.

关键词：铁皮石斛、叶绿体基因组、重复序列、系统发育

所属期刊栏目：41

分类号：S567.23+9(经济作物)

资助基金：高校国内访问工程师校企合作项目FG2021003

在线出版日期：2022-11-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：35-41