3个不同品种百香果转录组分析

摘要：

以黄果 、满天星和紫果3个不同品种百香果果皮和果肉为材料,采用2代Illumina高通量测序技术进行转录组测序,获得黄果果皮47875830条 、果肉44325678条,满天星果皮47019772条 、果肉45472434条,紫果果皮48789846条 、果肉49372968条Clean reads片段,包含黄果果皮7181374500 nt、果肉6648851700 nt,满天星果皮7052965800 nt、果肉6820865100 nt,紫果果皮7318476900 nt、果肉7405945200 nt核苷酸序列信息;经拼接组装,分别获得平均长度为1487 nt的黄果34968条Unigene片段,平均长度1361 nt的满天星41896条Unigene片段和平均长度1329 nt的紫果41701条Unigene片段.GO富集分析表明,在生物过程 、细胞组分和分子功能3大类别上,黄果 、满天星和紫果间均分布有差异基因.KEGG富集分析表明,黄果与满天星在细胞胞吞作用过程中存在较大差异,黄果与紫果在玉米素生物合成和糖酵解途径中差异基因富集显著,满天星与紫果在缬氨酸 、亮氨酸和异亮氨酸生物合成中存在较大差异.

关键词：百香果、转录组、基因差异表达

所属期刊栏目：38

分类号：S667.9(果树园艺)

资助基金：贵州省农业科学院 2017 年度学术新苗培养及创新探索专项 —— 西番莲糖含量差异及糖代谢相关基因表达分析黔农科院青年基金[2018]89 号;西番莲果实营养成分及主要成分分析与研究黔农科院青年基金[2018]09 号;贵州北盘江流域西番莲区域试验及配套栽培模式研究黔科合支撑[2016]2527 号;贵州省科技厅项目"台湾等地区优新果树品种引进试种及示范"黔科合 NZ [2015]3001;贵州省科技厅项目"贵州省果树科学研究所扶贫能力建设"黔科合平台人才[2017]5795-3;科技部项目"贵州山地特色果树资源评价与应用创新平台"黔科中引地[2018]4002

在线出版日期：2019-07-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

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