不同来源产气荚膜梭菌β 2毒素编码基因的PCR检测方法建立及遗传多态性分析

摘要：

目的:建立并优化产气荚膜梭菌β
2毒素编码基因（
cpb
2）和非典型
cpb
2（
aty-cpb
2）的PCR检测方法，分析2016-2021年中国9个地区
cpb
2流行特征和遗传多态性。
方法:使用PCR方法对188株产气荚膜梭菌菌株的
cpb
2进行检测，通过全基因组测序获取
cpb
2序列以分析其遗传多态性，使用Mega 11、Makeblastdb软件对110株产气荚膜梭菌所携带的
cpb
2构建系统发育树并建库，通过Blastn算法比对后得出
cpb
2两种不同基因型，即共有
cpb
2（
con-cpb
2）和
aty-cpb
2之间的序列相似性。
结果:针对产气荚膜梭菌
cpb
2和
aty-cpb
2建立及改进的PCR检测方法的特异性好。
cpb
2的PCR检测结果与全基因组测序结果高度一致（Kappa=0.946，
P<0.001）。来自中国9个地区的菌株中共有107株菌携带
cpb
2，94株A型菌株携带
aty-cpb
2，6株A型菌株携带
con-cpb
2，7株F型菌株携带
aty-cpb
2。两种不同基因型的
cpb
2核苷酸序列相似性为68.97%~70.97%，相同基因型的
cpb
2核苷酸序列相似性为98.00%~100.00%。
结论:本研究建立了特异性好、一致性高的
cpb
2的PCR检测方法，并针对既往检测
aty-cpb
2的PCR方法特异性差的缺陷进行了改进。
cpb
2以
aty-cpb
2为主且
cpb
2的不同基因型之间核苷酸序列差异大。

关键词：产气荚膜梭菌、β 2毒素 、遗传多态性

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资助基金：国家重点研发计划2021YFC2301000;传染病预防控制国家重点实验室自主研究课题2021SKLID207;National Key Research and Development Program of China2021YFC2301000;Open Project Supported by State Key Laboratory of Infectious Disease Prevention and Control2021SKLID207

在线出版日期：2023-05-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：636-642