2011年河南省脑炎患者柯萨奇病毒B5型分离株基因组序列分析

摘要：

目的 分析河南省柯萨奇病毒B5(CVB5)分离株全基因序列,了解其遗传特性.方法 采集2例脑炎患者临床标本,分离病毒,提取病毒阳性分离物RNA,进行RT-PCR扩增,产物直接测序.利用DNAStar 5.01和Mega 5.05软件进行全基因序列拼接及亲缘进化分析.结果 获得2株CVB5分离株(03001N和17Y)全基因组序列,核苷酸长度分别为7408 bp和7404 bp,两者核苷酸同源性为97％,同2010年河南CVB5分离株同源性最高,分别为98％和99％.5”-UTR分别为747 bp和743 bp;3’-UTR区均为103bp;病毒基因组编码区全长同为6558 bp,编码含2185个氨基酸残基的多聚蛋白,氨基酸同源性为99％.VP1区系统发生树分析显示,2株CVB5分离株进化关系较近,同近年来国内其他分离株成一簇,而2009年的河南省CVB5分离株同山东省CVB5分离株成一簇.结论 河南省内存在不同CVB5株传播链的流行,此次分离株为近几年内的主要流行株.

关键词：柯萨奇病毒B5型、脑炎、系统进化分析

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资助基金：河南省科技厅项目122400450357;河南省医学科技攻关计划省部共建项目201201003This work was supported by grants from the Henan Department of Science and Technology Project127400450357;Henan Province Health Department and China”s Ministry of Health Co-build Project201201003

在线出版日期：2014-02-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

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