骨质疏松症关键基因的筛选及生物信息学分析

摘要：

目的:通过生物信息学的方式筛选骨质疏松症关键基因，并进一步分析其与骨质疏松症的联系及作用机制。方法:从公共基因表达数据库下载基因表达谱数据集，通过R软件筛选差异表达基因并进行功能与通路分析。使用在线工具String构建蛋白质互作网络，导入cytoscape软件筛选关键基因并构建集簇模块。结果:共筛选出1 334个差异表达基因，其中上调基因722个，下调基因612个。GO分析显示功能主要富集在细胞外基质结构成分，信号受体激活剂活性，跨膜转运蛋白结合及细胞因子结合等方面。KEGG通路富集中显示差异基因主要参与PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、Rap1信号通路以及Ras信号通路等通路。根据蛋白质互作网络筛选出AKT1、EGF、VEGFA、PROM1、TP53、NES、CD21、SNAI1、FGF13、LIF共十个关键基因，以及一个集簇模块。结论:筛选并分析了关键基因与集簇模块的功能、作用及其与骨质疏松可能存在的联系，为揭示骨质疏松症潜在的的分子机制和药物靶点提供新的思路。

关键词：骨质疏松症、差异基因表达、关键基因筛选、生物信息学

所属期刊栏目：09

资助基金：吉林省科技发展计划项目20200404140YY

在线出版日期：2023-07-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：18-22