PCR-荧光探针法在中国HCV常见基因型检测中的意义

摘要：

目的 探讨聚合酶链反应(Polymerase chain reaction,PCR)-荧光探针法在检测丙型肝炎病毒(HCV)基因型中的应用价值.方法 随机选择2016年3月至6月来自全国各地的166例慢性HCV感染者血清样本,采用逆转录巢式PCR扩增HCV的Core-E1(CE1)基因区域和测序、系统发育树分析确定基因亚型,并采用PCR-荧光探针法对HCV基因型进行检测.采用Kappa检验对两种方法测得的HCV分型结果进行比较.结果 巢式PCR测序法共分型166例,其中1 b型66例(39.8%),2a型34例(20.5%),3a型16例(9.6%),3b型为27例(16.2%),6a型23例(13.9%);PCR-荧光探针法共分型166例,其中1 b型68例(41.0%),2a型34例(20.5%),3a型16例(9.6%),3b型25例(15.0%),6a型23例(13.9%).PCR-荧光探针法分型中的2例1 b型,测序法分型为3b型,两种方法检测一致率为98.7%(164/166),差异无统计学意义(χ2=0.0492,P>0.05).结论

关键词：肝炎、丙型、基因型、聚合酶链反应、PCR-荧光探针法、逆转录巢式PCR、系统发育树

所属期刊栏目：10

分类号：R5 ;R51

资助基金：海南省应用技术研发与示范推广专项 ZDXM2015072Special Application Technology Research and Development and Demonstration Promotion of Hainan ProvinceZDXM2015072

在线出版日期：2017-03-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：37-42