基于TCGA数据库分析SCAMP3在肝细胞癌的表达及预后情况

摘要：

目的:分析载体膜蛋白3(SCAMP3)在肝细胞癌中的表达和对预后的影响以及基因集富集分析。方法:通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库分析SCAMP3表达和预后。收集2021年1月期间丽水市中心医院4例肝细胞癌患者的癌组织及癌旁组织检测SCAMP3的表达。基于TCGA数据，单因素和多因素Cox回归分析SCAMP3表示与肝细胞癌患者预后关系。利用基因集富集分析探索SCAMP3的生物学作用。结果:TCGA数据库中，肝细胞癌组织中SCAMP3表达高于正常肝组织，差异有统计学意义(
Z＝－8.38，
P<0.001)。基于SCAMP3表达的中位数将患者分为低表达组(
n＝185)和高表达组(
n＝185)，SCAMP3高表达患者总体生存率更低。手术切除的4例肝细胞癌患者癌组织和癌旁组织，癌组织中SCAMP3 mRNA、蛋白相对表达均高于癌旁组织，差异均有统计学意义(
t＝8.55、6.24，均
P<0.001)。多因素Cox回归分析，SCAMP3表达越高，死亡风险越高(
HR＝1.466，95%
CI：1.143～1.881，
P<0.001)。基因集富集分析在SCAMP3高表达患者中，凝血级联和补体、视黄醇代谢、过氧化物酶体增殖物激活受体三种信号通路被识别。
结论:SCAMP3在肝细胞癌表达升高，高表达患者生存预后更差。SCAMP3高表达是肝细胞癌患者生存预后的危险因素。SCAMP3高表达与补体和凝血级联反应、视黄醇代谢、过氧化物酶体增殖物激活受体通路有关。

关键词：癌，肝细胞、分泌载体膜蛋白、癌症基因组图谱、基因集富集分析

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资助基金：浙江省基础公益计划项目LY19H030004;浙江医药卫生计划项目2020KY1088;丽水市科技计划项目2017GYX11;Zhejiang Basic Public Welfare Programme ProjectLY19H030004;Zhejiang Medicine and Health Programme Project2020KY1088;Lishui Science and Technology Programme Project2017GYX11

在线出版日期：2024-01-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：27-32