基于铜死亡相关基因标签预测肝细胞癌的预后、药物敏感性及免疫治疗反应

摘要：

目的:构建铜死亡相关基因标签(CRGS)，基于CRGS预测肝细胞癌(HCC)患者的预后、免疫治疗反应及药物敏感性。方法:从国际癌症基因组联盟(ICGC)和癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载HCC患者的RNA测序和相应的临床数据，从人类蛋白质图谱图像分类(HPA)数据库获得肝癌组织和正常肝脏组织的蛋白表达信息，并从Migort210数据库下载HCC患者的基因表达信息和免疫治疗反应情况。基于TCGA队列，应用最小绝对值收敛和选择算法(LASSO)构建CRGS，计算每个样本的风险分数，根据风险分数的中位数对HCC患者进行分组：TCGA队列分为高风险组
TCGA和低风险组
TCGA，每组184例；ICGC队列分为高风险组
ICGC和低风险组
ICGC，每组116例。在Migort210队列中根据免疫治疗应答反应分为应答组(
n＝68)和非应答组(
n＝230)。评估CRGS预判TCGA队列中HCC患者预后的价值。在ICGC数据集中验证CRGS是否可用于预测HCC患者的预后。基于TCGA队列的数据，探讨CRGS预测HCC患者免疫治疗反应、药物敏感性的作用，同时应用Migort210免疫治疗队列验证CRGS预测恶性肿瘤免疫治疗中的临床价值。
结果:CRGS由4个铜死亡相关基因构成：GLS、CDKN2A、LIPT1和DLAT。高风险组
TCGA患者的总生存期(OS)、疾病特异性生存期和无进展间期均低于低风险组
TCGA(均
P<0.01)。高风险组
ICGC患者的OS低于低风险组
ICGC(
P＝0.022)。多因素Cox回归分析结果显示，CRGS是HCC患者不良预后的的独立危险因素(TCGA：
HR＝2.991，95%
CI：1.781~5.049，
P<0.001；ICGC：
HR＝4.621，95%
CI：1.685~12.674，
P＝0.033)。风险分数与CTLA4、PDCD1、CD80和HLLA2的表达量呈正相关(均
P<0.001)。高风险组
TCGA患者的肿瘤免疫功能障碍与排斥评分低于低风险组
TCGA[－0.04(－0.07，－0.02)分比－0.02(－0.04，0)分]，差异具有统计学意义(
P<0.001)。应答组患者的风险分数高于非应答组[1.70(1.56，1.90)比1.63(1.52，1.80)]，差异具有统计学意义(
P<0.05)。高风险组
TCGA患者对于舒尼替尼、雷帕霉素和乙胺嘧啶的半数抑制浓度(IC
50)高于低风险组
TCGA患者，而对厄洛替尼的IC
50低于低风险组
TCGA患者，差异均具有统计学意义(均
P<0.001)。
结论:CRGS可作为预测HCC患者预后、免疫治疗反应及药物敏感性的潜在生物标志物。

关键词：癌，肝细胞、铜死亡、免疫治疗、预后、药物敏感性

所属期刊栏目：29

在线出版日期：2023-07-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：449-454