10.3760/cma.j.issn.1007-8118.2015.03.011
胰腺导管腺癌中差异表达的长链非编码RNA筛选及分析
目的 筛查及分析胰腺导管腺癌中长链非编码RNA(lncRNA)及mRNA的差异表达谱,以及这些特异性lncRNAs的潜在通路、互作分子.方法 通过对5对胰腺导管腺癌/癌旁组织的芯片筛选及生物信息分析,构建共表达网络,结合国内外文献及多个数据库进行分析,预测lncRNA的潜在靶点、通路及互作关系.结果 按上调或下调5倍、P<0.01的标准,筛选得到癌及癌旁组织中差异表达的lncRNA 414个,mRNA 713个.迸一步生物信息学分析得到AC112229.1、RPL35AP、AC090377.1、UCA1、RP11-534L6.2、SAT1、AC027119.1、AK094786、BC042017、RP11-738E22.1、AC015818.5等11个可能参与胰腺导管腺癌发生发展关键环节的lncRNAs.结论 LncRNAs与胰腺导管腺癌的发生发展密切相关,深入相关研究对胰腺导管腺癌的诊断、治疗及预后判断具有重要意义.
胰腺肿瘤、长链非编码RNA、基因芯片、计算生物学
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上海市科学技术委员会医学引导项目124119a0501;第二军医大学优秀青年学者培养计划基金
2015-04-29(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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