基因芯片技术在肝癌转移相关基因筛选中的应用

摘要：

目的在全基因组范围内筛选与肝细胞癌转移相关的基因.方法采用基因芯片技术比较20例不伴与伴有肝内转移(门静脉癌栓)的肝细胞癌之间基因表达谱的差异,寻找与肝癌转移相关的基因.基因芯片由美国国立卫生研究院癌症研究所(NCI)制定,每张芯片有9984个点、含9180个基因.基因芯片实验采用双色荧光直接标记法,每例病人的无瘤肝组织总RNA 100 μg用红色荧光素Cy3-dUTP标记,其相应肝癌组织总RNA 200 μg用绿色荧光素Cy5-dUTP标记.混合后与芯片上的基因进行杂交.采用NCI开发的BRB-阵列软件包中先导的"分类比较法"(Class Comparison Tool)对基因芯片资料进行统计分析以寻找伴和不伴转移的肝癌之间表达有差异的基因.结果伴有转移的肝癌与不伴转移的肝癌之间基因表达谱差异明显,在9180个基因中224个基因表达差异有显著性(P<0.002),从中筛选出36个在两组间差异更加明显、可能与肝癌转移密切相关的候选基因,其中许多基因是属于细胞黏附和基质降解方面的,如骨桥蛋白,alpha 9 integrin,interleukin 2 receptor,serine proteinase inhibitor member 5, MMP9, leukocyte immunoglobulin-like receptor A member2及CD37 antigen等,这些基因在肝癌转移过程中可能起了非常重要的作用.结论基因芯片技术是一种快速、高效、高通量的研究生物信息的分子生物学技术;与细胞黏附和基质降解有关的基因变化可能在肝癌转移中起重要作用.

关键词：癌、肝细胞、基因芯片、转移

所属期刊栏目：10

分类号：R31;R73

在线出版日期：2005-01-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：679-682