基于转录组测序的脓毒症小鼠脾脏差异表达基因分析

摘要：

目的:研究脂多糖(LPS)诱导的脓毒症小鼠脾脏中mRNA表达变化及特征,寻找影响脓毒症病理生理进程的信号通路.方法:将50只小鼠分成LPS组和Sham组,每组25只,比较两组小鼠存活率及血清中肿瘤坏死因子(TNF)-α、白细胞介素(IL)-6和IL-1β水平.提取脾脏中mRNA,利用转录组测序技术测定基因表达量,随后通过两种富集方法分析:寻找差异表达基因(P<0.05,|log2FoldChange|≥1)进行GO和KEGG分析以及在GSEA v4.0.1软件中富集P<0.05,Q<0.25的基因.RT-qPCR验证10个显著差异表达基因.结果:LPS成功构建脓毒症模型,表现出严重炎症反应和高死亡率.LPS组对比Sham组显著改变的差异表达基因有1616个,其中下调基因919个,上调基因697个.富集分析涉及多条炎症反应、调控遗传信息、参与信号转导和细胞过程的通路.RT-qPCR验证结果显示10个基因表达趋势与测序结果一致.结论:胞质DNA传感途径可能在脓毒症病理过程中起着重要作用,Zbp1、Ddx58、Cxcl10、Polr1d可能是其发挥功能的重要靶点.

关键词：脓毒症、转录组测序、mRNA、基因表达

所属期刊栏目：28

分类号：R246.9;R631(中医临床学)

资助基金：国家自然科学基金;上海市卫生和计划生育委员会科研课题

在线出版日期：2022-08-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：531-537