富含亮氨酸重复序列和免疫球蛋白样结构域1(LRIG1)基因在非小细胞肺癌中的表达、信号通路及其与预后的关系

摘要：

目的:探讨富含亮氨酸重复序列和免疫球蛋白样结构域1(LRIG1)基因在非小细胞肺癌(NSCLC)患者中的表达、相关信号通路及其与患者预后的关系.方法:依靠癌症基因组图谱(TCGA)数据库分析LRIG1基因mRNA在NSCLC患者癌组织和癌旁组织中的表达水平;依靠蛋白相互作用(STRING)数据库构建LRIG1蛋白-蛋白相互作用网络,并对相关蛋白功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路进行富集.同时分析比较LRIG1基因表达与NSCLC患者总生存期和无疾病进展生存期的关系.选取手术治疗的96例NSCLC患者,采用免疫组织化学法检测LRIG1蛋白在癌组织和癌旁组织中的表达,对数据库分析结果进行验证.结果:LRIG1基因在癌旁正常组织中表达水平较高,而在癌组织中表达较低;与LRIG1蛋白相互作用较为紧密的10蛋白相互作用网络富集显著(P<0.001);共表达分析显示,L-型电压依赖性钙离子通道α1D亚基(CACNA1D)基因与LRIG1基因正向共表达最为明显(r=0.51,P<0.05),而G蛋白信号转导调节因子20(RGS20)基因与LRIG1基因负向共表达最为明显(r=–0.49,P<0.05);LRIG1基因生物学过程、细胞成分和分子功能主要分别富集于表皮生长因子受体信号通路的负调控、胞质囊泡部和磷脂酰肌醇-4,5-二磷酸3-激酶活性等;LRIG1基因主要富集于癌症中的蛋白多糖、内吞作用、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、磷脂酰肌醇-3激酶/蛋白激酶B(PI3K-AKT)信号通路、Ras相关蛋白1(RAP1)信号通路、癌症的途径和ras等肿瘤相关信号通路;LRIG1基因mRNA高表组患者的总生存期高于低表达组[(风险比(HR)=0.74,P<0.05)],而两组的无疾病进展生存期差异无统计学意义(HR=1.0,P=0.97);LRIG1蛋白在NSCLC癌旁组织的阳性表达率显著高于癌组织(P<0.05).LRIG1蛋白高表达与NSCLC患者临床分期、肿瘤大小及纵膈淋巴结转移有关(P<0.05).结论:LRIG1基因在NSCLC癌组织中低表达,并与患者肿瘤大小、淋巴结转移及总生存期有关.

关键词：非小细胞肺癌、TCGA数据库、LRIG1基因、生存期

所属期刊栏目：26

分类号：R734.2(肿瘤学)

在线出版日期：2020-10-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：792-799