基于生物信息学方法研究IgA肾病患者肾组织的核心基因及免疫微环境

摘要：

目的:通过生物信息学方法分析IgA肾病患者肾组织的核心基因和免疫细胞浸润特点,探索IgA肾病的发病机制.方法:从GEO数据库下载GSE104948、GSE104954、GSE37460和GSE35487的基因表达矩阵,运用R语言筛选差异表达基因,利用STRING数据库和Cytoscape软件构建蛋白互作网络,并计算核心基因.运用CIBERSORTx数据库分析不同组别的免疫细胞浸润特点.结果:共获得218个差异表达基因,筛选出22个核心基因,如C1QA、C1QB、CD48、CD53、CSF1R等.与正常组相比,IgA肾病患者肾组织中初始B细胞、记忆CD4+T细胞、树突状细胞、活化肥大细胞和中性粒细胞水平降低;M0型巨噬细胞、M1型巨噬细胞和M2型巨噬细胞、NK细胞、单核细胞、静息肥大细胞水平增高.结论:IgA肾病肾组织免疫细胞以巨噬细胞浸润为主要特点,其核心基因主要与炎性反应和免疫调节紊乱有关.

关键词：IgA、肾病、生物信息学、核心基因、免疫微环境

所属期刊栏目：24

分类号：R735.7;R318;R-058

资助基金：内蒙古自治区研究生科研创新项目;内蒙古自治区自然科学基金面上项目;内蒙古医科大学科技百万工程项目;内蒙古自治区自然科学基金联合项目

在线出版日期：2023-09-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：605-607,后插3