基于生物信息学和分子对接探讨"柴胡-黄芩"治疗IgA肾病机制的研究

摘要：

目的:利用生物信息学和分子对接技术探讨"柴胡-黄芩"药对干预IgA肾病差异表达基因的调控机制及物质基础.方法:筛选差异表达基因综合数据库GEO中IgA肾病基因样本,在中药系统药理学数据库与分析平台TCMSP上筛选"柴胡-黄芩"药对的活性成分,将IgA肾病的差异基因和"柴胡-黄芩"药对的靶标蛋白取交集,用Cytoscape软件构建调控网络和蛋白相互作用网络,并进行拓扑结构分析及关键靶点筛选关键节点.利用PyMoL及AutoDock Vina软件对主要活性成分及高频靶标进行分子对接验证.用R i3863.6.2对交集基因进行GO富集分析和KEGG富集分析.结果:分析IgA肾病患者与正常人相比的差异基因,得到明显影响和改变的基因共347个,其中上调基因104个,主要富集在炎症反应中细胞纤维化、TNF信号通路和MAPK信号通路.从柴胡、黄芩中筛选槲皮素、山柰酚、黄芩素等38个活性成分,作用于JUN、MYC、CDKN1A等20个IgA肾病差异表达基因靶点,调节晚期糖基化终末产物及其受体(AGEs-RAGE)介导的信号通路、IL-17信号通路、TNF信号通路等多种生物过程.结论:"柴胡-黄芩"的有效成分通过多个靶点、多条通路药干预IgA肾病差异基因表达.

关键词："柴胡-黄芩"药对、IgA肾病、GEO差异基因分析、网络药理学、调控机制、物质基础

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分类号：R-058;R737.9;R587.1

资助基金：上海中医药大学沛然计划项目No.JY611.27.01.03

在线出版日期：2022-07-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：312-316,后插3-后插4