宏基因组二代测序对重症社区获得性肺炎患者的病原学诊断及预后分析

摘要：

目的 评价宏基因组二代测序(mNGS)对重症社区获得性肺炎(SCAP)患者病原微生物的检测能力及对预后影响.方法 采用回顾性研究方法.选择 2018 年 3 月至 2022 年 12 月入住安徽医科大学附属省立医院重症医学科并接受支气管肺泡灌洗液(BALF)mNGS的 65 例SCAP患者,并与同期仅进行传统病原学检测(CMT)的患者按 1∶1 配对,配对标准为性别、年龄差值在 5 岁以内、基础疾病、免疫状态、急性生理学与慢性健康状况评分Ⅱ(APACHEⅡ)差值在 3 分以内、肺炎严重指数(PSI)评分.观察的主要终点为 90 d病死率;次要终点包括重症监护病房(ICU)住院时间、机械通气时间、7 d内肺炎好转率、28 d病死率,并绘制Kaplan-Meier生存曲线比较两组 90 d累积生存率.结果 CMT组有 16 例(24.62%)阴性结果,而mNGS组仅有 1 例(1.54%)阴性结果(P＜0.05).在收到微生物学检测报告后,mNGS组有 42 例患者(64.62%)进行了抗感染方案的调整,而CMT组只有 18 例(27.69%)进行了调整(P＜0.05).mNGS组检测到的细菌总数显著高于CMT组(49 株比 25 株,P＜0.05).mNGS组患者真菌检出总数高于CMT组(14 株比 5 株,P＜0.05).mNGS组和CMT组所检出的病毒总数差异无统计学意义(6 株比 8 株,P＞0.05).mNGS组中 41 例患者(63.08%)在随后的 7 d内肺部感染的情况得到改善,而CMT组中只有 24 例患者(36.92%)得到改善(P＜0.05).mNGS组机械通气时间(d:6.64±1.53 比 6.84±1.28,P＜0.05)和ICU住院时间(d:8.68±1.78 比 9.28±1.66,P＜0.05)均显著短于CMT组,mNGS组患者的 28 d病死率(16.92%比 36.92%,P＜0.05)和 90 d病死率(24.62%比 43.08%,P＜0.05)也显著低于CMT组.Kaplan-Meier生存曲线显示,mNGS组90 d累积生存率明显高于CMT组(Log-Rank检验:χ2=7.528,P=0.026).结论 mNGS对SCAP患者的病原微生物学较CMT有更高的检测能力,临床医师据此选择了更合适的治疗方案,也间接改善了患者预后.

关键词：重症社区获得性肺炎、支气管肺泡灌洗液、宏基因组二代测序、病原微生物学、预后

所属期刊栏目：30

分类号：R739.63;R563.1;R4

在线出版日期：2023-08-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：271-276