生物信息学分析筛选胆管癌新候选基因及其意义

摘要：

目的 应用综合生物信息学分析、筛选胆管癌新候选基因,并探讨其在预测患者预后方面的价值.方法 从The Cancer Genome Atlas(TCGA)数据库下载数据,通过与癌旁组织进行比较,筛选出差异表达基因,并通过生物信息学方法对其进行深入分析.结果 共筛选出差异表达的信使RNA(messenger RNA,mRNA)3538个、长链非编码RNA(long nonco-ding RNA,lncRNA)1434个和微RNA(microRNA,miRNA)68个.建立一个包含127个lncRNA、15个miRNA和64个mRNA的竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)网络.生存分析发现,COL18A1-AS1、LINC00261、NEXN-AS1、SCRN1和SLC6A1-AS1基因对胆管癌预后具有预测价值,上述基因低表达患者的生存率均显著高于高表达患者.结论 COL18A1-AS1、LINC00261、NEXN-AS1、SCRN1和SLC6A1-AS1基因可作为评估胆管癌预后的标志物,可为胆管癌的治疗提供新的潜在靶点.

关键词：胆管癌、生物信息学分析、竞争性内源RNA、长链非编码RNA

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在线出版日期：2020-08-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：123-128