人3p24-p25 478 kb完全基因组序列的注释

摘要：

目的对我国承担的人类基因组测序项目中的3p24-p25 478kb完全基因组序列进行注释.方法采用从头预测、数据库相似性比较和全长或部分mRNA序列与基因组序列的比对等手段,识别基因组序列中的编码蛋白质的基因,并采用EMBOSS软件包分析基因组序列的组分特征.结果识别出该区域中的两个编码蛋白质的已知基因,即SLC6A1和SLC6A11(其中后者在基因组草图序列中未被定位);对这段基因组序列中组分特征预测分析结果显示,该基因组序列的平均GC含量为47%,并存在3个假想的CpG岛,其中两个CpG岛分别位于130685～131 516 bp及307090～307 870 bp,另一个位于415 585～416 308 bp.结论采用上述方法对基因组序列3p24-p25 478kb进行了正确的注释,揭示了基因组序列中的有关的基因结构、GC含量、CpG岛等信息.

关键词：人类基因组计划、基因组注释

所属期刊栏目：24

分类号：Q343.1(遗传学分支学科)

资助基金：国家自然科学基金39625007,39993420;国家高技术研究发展计划863计划102-10-03-05;国家重点基础研究发展计划973计划G1998051003

在线出版日期：2004-01-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：259-263