基于生物信息学分析的miR-125b-1-3p和NR3C1在妊娠糖尿病患者中的表达及临床意义
目的 通过生物信息学分析探索miR-125b-1-3p和NR3C1在妊娠糖尿病(GDM)患者中的表达及临床意义.方法 在基因表达综合数据库(GEO)中寻找目标数据集并筛选GDM的差异表达miRNA和mRNA,再进行基因本体(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析.利用绘制蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络,筛选GDM关键基因,并进行可视化分析.通过GEO数据库和RT-qPCR技术对miR-125b-1-3p和NR3C1的表达量进行验证;利用双萤光素酶报告基因测定miR-125b-1-3p对靶基因NR3C1的直接结合和转录物活性的影响.结果 检索得到样本类型为血浆的GSE186883数据集,共得到267个差异表达miRNA,均为下调miRNA.从GEO数据库中得到1个独立的GDM胎盘脐带血微阵列数据集GSE203346,得到477个差异表达基因,其中下调基因295个,上调基因182个.KEGG分析结果显示,差异表达基因主要与Toll样受体信号通路、自然杀伤细胞介导的细胞毒性、Ⅰ型糖尿病、NOD样受体信号通路相关.从GEO数据库中得到1个独立的妊娠糖尿病胎盘微阵列数据集GSE203346,共有9585个差异表达基因,其中下调基因9245个,上调基因340个.在miRDB中预测到24个miR-125b-1-3p靶基因,在miRTarBase中预测到13个靶基因,在TargetScan中预测到489个靶基因.分析得到与疾病显著相关的miR-125b-1-3p靶基因NR3C1.与正常孕妇相比,GDM患者miR-125b-1-3p的表达水平降低、NR3C1的表达水平升高(P＜0.05),NR3C1的水平与miR-125b-1-3p的表达呈负相关(P＜0.05).双萤光素酶报告基因检测提示miR-125b-1-3p通过靶NR3C1 mRNA的3'-UTR来抑制NR3C1表达.结论 通过生物信息学分析,miR-125b-1-3p和NR3C1可为GDM寻求潜在分子标志物提供理论依据.
miR-125b-1-3p、NR3C1、妊娠糖尿病、生物信息学分析
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R473.5;R714.256;R3
2024-06-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共9页
706-714
