长链非编码核糖核苷酸HLA-DQA2与不明原因复发性流产的关联

摘要：

目的 通过对不明原因复发性流产(URSA)孕妇绒毛组织的lncRNA比对参考基因组进行注释,探究URSA中潜在的lncRNA生物学靶点.方法 收集4例URSA(实验组)和4例选择性终止妊娠(ETP)孕妇(对照组)的绒毛组织样本,使用String Tie处理并预测各转录本,DESeq2获得差异表达lncRNA,Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)富集分析对lncRNA反式调控及lncRNA顺式调控潜在通路进行探索.结果 使用4种编码潜能分析方法对候选lncRNA进行进一步的筛选,共有474个共表达转录本,接着DESeq2获得差异表达lncRNA,有705个显著上调lncRNA数目和107个显著下调表达lncRNA数目,对差异表达的lncRNA和所有差异表达的基因进行共表达分析,其中lncRNA反式调控分子功能主要作用在蛋白结合,生物过程发生在细胞外基质组织,存在于细胞表面.KEGG结果显示其主要是作用于lncRNA HLA-DQA2进而富集在金黄色葡萄球菌感染通路.lncRNA顺式调控分子功能主要作用在蛋白结合,生物过程发生在RNA聚合酶对转录的调节,存在于核染色质.KEGG富集结果显示其主要是作用于lncRNAHLA-DQA2以及BIRCT进而富集在弓形体病感染通路.结论 lncRNA HLA-DQA2可能通过调控炎症感染信号通路导致不明原因复发性流产,其可能成为潜在的治疗靶点.

关键词：不明原因复发性流产、绒毛组织、长链非编码RNA、转录组测序

所属期刊栏目：32

分类号：R737.33;R541.4;R644

资助基金：新疆维吾尔自治区自然科学基金资助项目;国家自然科学基金;新疆医科大学校级重点实验室建设项目

在线出版日期：2024-06-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：674-680