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脊髓性肌萎缩症并发希特林蛋白缺乏症患儿及家系经基因变异检测和生物信息学结果分析

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目的 研究脊髓性肌萎缩症并发希特林蛋白缺乏症患儿及家系经基因变异检测和生物信息学结果.方法 将医院收治的1例脊髓性肌萎缩症并发希特林蛋白缺乏症患儿纳入研究.采集患儿及其双亲的外周血,进行全基因组脱氧核糖核酸(Deoxyribonucleic acid,DNA)的提取,同时进行全外显子组测序.在明确先证者的致病基因型后,采用桑格(Sanger)测序法完成验证,并对患儿双亲的变异情况予以检测.采用多重连接探针扩增杂交技术(Multiplex ligation-dependent probe amplification,MLPA)完成患儿运动神经元存活基因(survival motor neuron,SMN)基因的检测.结果 Sanger测序验证结果显示:线粒体聚合酶γ(mitochondrial DNA polymerase γ,POLG)基因和复合杂合变异相符,且变异c·948G>A(p.K316K)源自父亲,c·2693T>C(p.I898T)源自母亲;其中SCL25A13基因变异位点c·1737G>A(p·W579X)和二代测序结果存在明显差异,属于纯合变异,且未在患儿双亲的相同位点发现变异.IVSI6ins3kb变异检测结果显示SLC25A13基因存在3kb的插入,且主要来源于患儿父亲.由于患儿体格检查结果显示为颈部柔软,因此对患儿及其双亲同时开展脊髓性肌萎缩检测,结果发现患儿SMN1基因存在第7、8外显子的纯合缺失,患儿双亲在同一外显子均表现为杂合缺失,且与孟德尔遗传规律相符,提示患儿存在脊髓性肌萎缩症.结论 SLC25A13基因变异与脊髓性肌萎缩症患儿并发希特林蛋白缺乏症密切相关,且POLG基因变异c·948G>A以及c·2693G>A复合杂合变异可能引起患儿发生线粒体DNA缺失综合征4A型,值得临床重点关注.

脊髓性肌萎缩症;希特林蛋白缺乏症;基因变异检测;生物信息学

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2022-01-10(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

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中国优生与遗传杂志

1006-9534

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2021,29(7)

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