基于生物信息学分析FAM189A2在食管癌中的表达及临床意义

摘要：

目的 基于多种生物数据库探讨FAM189A2在食管癌中的表达及临床意义.方法 通过UALCAN对FAM189A2表达水平进行泛癌分析,分析其与食管癌分期、TP53突变的关系及甲基化水平.应用RT-PCR技术检测食管癌和正常食管中FAM189A2的表达水平.采用GEPIA分析FAM189A2对预后的影响,应用cBioportal和STRING数据库筛选共表达基因并构建调控网络.采用DAVID数据库将共表达基因进行基因本体论 (GO) 及京东基因和基因组 (KEGG) 富集分析.结果 FAM189A2 mRNA表达水平在食管癌中表达显著低于正常组织 (P < 0.05),且与临床分期、TP53突变状态等相关,差异均有统计学意义 (P < 0.05),FAM189A2低表达的食管癌患者预后不良 (P < 0.05),其低表达可能与甲基化有关,GO和KEGG富集分析结果显示,FAM189A2共表达基因主要参与细胞内信号传导、PI3K-Akt信号通路等.结论 FAM189A2在食管癌中表达低于正常组织,低表达患者预后不良,FAM189A2的表达与肿瘤的分期、病理分型和TP53突变状态密切相关.

关键词：食管癌、生物信息学、预后

所属期刊栏目：52

分类号：R730(肿瘤学)

资助基金：京津冀基础研究合作专项;天津市自然科学基金

在线出版日期：2023-04-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：236-241