基于诱导多能干细胞的Alport综合征差异性表达小核糖核酸的生物信息学分析

摘要：

目的 寻找Alport综合征患者(AS)与健康对照者(NC)差异性表达小核糖核酸(microRNAs).分析差异性表达microRNAs的生物信息学特点.方法 收集AS与NC组的尿液,从尿液中分离尿肾脏管细胞,将尿肾脏管细胞诱导分化成多能干细胞(iPSCs).运用高通量测序找出2组之间差异性表达的microRNAs,用于预测特异性靶基因.靶基因可进行gene ontology(GO)富集与Kyoto encyclopedia of genes and genomes(KEGG)通路信号分析.确定差异性表达的microRNAs靶基因的主要富集位点与通路信号条目.结果 在2组样本中发现30个microRNAs具有差异性表达,包括19个上调与11个下调.差异性表达microRNAs靶基因GO富集主要聚集在细胞分子、细胞组成与细胞生物学过程.嘌呤代谢通路与丝裂原激活的蛋白激酶是主要的KEGG信号传导通路.结论 差异性表达microRNAs靶基因的生物信息学可能在AS发病机制中起重要作用,可作为潜在靶点用于AS病因的深入研究.

关键词：Alport综合征、小核糖核酸、GO富集、KEGG通路

所属期刊栏目：43

分类号：R394-33

资助基金：深圳市卫生局科技项目201202139

在线出版日期：2014-09-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：625-630