宁波地区新生儿轮状病毒VP7基因序列分析

摘要：

目的 研究宁波地区新生儿轮状病毒流行株VP7基因的分子生物学特点以及遗传变异规律.方法 通过聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)检测新生儿病毒性腹泻便样中的轮状病毒核酸;选择特殊电泳带型样品通过逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)扩增VP7全基因并测序;测序结果利用DNAstar和Blast软件进行比对.结果 通过PAGE发现11份样品中有9份阳性样品,其中带型为4-2-3-2的有7份,带型为3-2-2-2和4-2-1-2的各1份.3种带型各选一株进行VP7基因的扩增并测序,测序结果经分析发现,06NB3和06NB9与G1型标准株Wa的核苷酸同源性为84.4 % 和91.5%,氨基酸同源性分别为87.4% 和94.8%,06NB2与 G3型标准株YO的核苷酸同源性为95.3%,氨基酸的同源性为 96.6%.结论 宁波地区在新生儿中有A组轮状病毒流行,其电泳带型以典型的4-2-3-2为主,也可见特殊带型.06NB3和06NB9的VP7基因片段属G1型,06NB2则属于G3型.06NB3与国内外近几年流行的G1型毒株基因序列有较大差异,06NB9和06NB2则差异较小.

关键词：新生儿腹泻、轮状病毒、VP7基因、序列分析

所属期刊栏目：8

分类号：R1(预防医学、卫生学)

在线出版日期：2007-11-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：411-415