基于RNA-Seq筛选禽致病性大肠杆菌损伤雏鸡小肠差异表达基因

摘要：

为筛选禽致病性大肠杆菌(APEC)感染雏鸡后其小肠损伤的差异表达基因,本研究利用APEC菌株经腿部肌肉途径接种两周龄雏鸡,对照组鸡以相同的途径注射相同体积的生理盐水,选取病变严重的肠道与对照组肠道,利用高通量RNA-Seq技术筛选出雏鸡小肠受APEC损伤后的差异表达基因,对其进行生物信息学GO功能分类和KEGG信号通路分析,并利用荧光定量PCR验证部分差异表达基因.结果显示差异变化在2倍以上的基因共有131个,其中74个上调表达,57个下调表达.GO功能分类结果显示,这些基因主要涉及到蛋白结合、免疫反应、转运活动等功能.KEGG分析表明这些差异表达基因参与PPAR、新陈代谢、细胞因子受体相互作用、Jak-STAT、RIG-I-样受体、吞噬体等信号通路.本研究为进一步研究APEC的致病作用及宿主抗病机制奠定了基础.

关键词：禽致病性大肠杆菌、雏鸡小肠、转录组测序、差异表达基因

所属期刊栏目：38

分类号：S852.61(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家自然科学基金项目31372402;安徽省自然科学基金1508085SQC206

在线出版日期：2016-03-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：111-115