羟基异吲哚酮类衍生物与HIV-1整合酶的分子模拟研究

代田洋刘嵬左柯杜文义梁立胡建平

成都大学;

摘要：

为了研究羟基异吲哚酮类衍生物与HIV-1整合酶识别的机制以及构象变化,采用AutoDock对58个羟基异吲哚酮类衍生物与整合酶进行了分子对接,并对抑制HIV-1整合酶活性较好的两个化合物所形成的复合物模型分别进行了16 ns的分子动力学模拟.基于对接复合物模型分析给出了化合物与整合酶结合的主要作用力,通过分析氢键以及构象的变化,发现氨基酸残基N155与D64之间的氢键是维持整合酶催化活性所必需的DDE基序结构稳定的关键.另外,氨基酸残基Y143所在的loop区与羟基异吲哚酮类衍生物之间的疏水作用力在受体-配体识别的过程中具有重要的作用.

关键词：羟基异吲哚酮类衍生物、分子对接、分子动力学模拟、HIV-1整合酶、构象分析

所属期刊栏目：47

分类号：Q5;R9

资助基金：国家自然科学基金资助项目11247018,11147175;四川省教育厅科研重点项目资助项目12ZA066;乐山市科技计划资助项目No.14SZD018This study was supported by the National Natural Science Foundation of China11247018,11147175;the Key Project of Scientific Research of the Department of Education of Sichuan Province12ZA066;the Science and Technology Planning Project of Leshan14SZD018

在线出版日期：2016-11-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：551-559