深县猪全基因组选择信号检测分析

摘要：

本研究旨在通过基因组重测序技术从分子层面深入了解地方猪种深县猪的种质遗传特性.实验以10头深县猪和10头梅山猪作为研究对象进行全基因组重测序,采用滑动窗口方法进行群体选择信号分析,结合群体遗传分化指数(Fst)和核酸多样性(θπ)2种参数筛选出受选择位点,调取相应的基因,并进行生物信息学分析.研究结果表明,深县猪独有的SNP变异位点有21 602 538个,对受选择区域筛选后得到受选择位点580个,定位于23个基因.GO和KEGG富集结果显示,与深县猪肉质、繁殖及免疫相关的候选基因有7个,这些候选基因通过参与激素合成、卵细胞成熟、脂质代谢以及免疫等信号通路发挥作用.基于全基因组重测序技术对候选基因的挖掘为揭示深县猪遗传特性以及保种选育工作的开展提供了参考.

关键词：深县猪;基因组重测序;SNP;选择信号;候选基因

所属期刊栏目：57

分类号：S828.2(家畜)

资助基金：河北省生猪产业技术创新体系项目HBCT2018110203

在线出版日期：2021-10-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：135-139