4个发育期香猪睾丸中piRNA簇的生物信息学分析

摘要：

为明确piRNA簇(Piwi-interactiing RNA Clusters)在香猪睾丸发育过程中的表达规律和调节作用,本实验选择4个发育期的雄性香猪12头:断奶期(2月龄)、初情期(3月龄)、性成熟期(6月龄)和体成熟期(12月龄),构建了4个小RNA文库,经小RNA测序,研究睾丸piRNA簇的数量、分布、来源、功能以及表达规律.结果 显示:从4个发育期睾丸组织中共发现了758个piRNA簇,其中198个簇2个及2个以上发育期共表达.piRNA簇在染色体上的分布不均匀,6号、14号染色体最为密集,Y染色体上没有检测到piRNA簇.4个发育期香猪睾丸中58％以上的piRNA簇处于低丰度表达(CPM<1),转座因子(TE)衍生的piRNA簇比例随月龄增加而下降,cDNA里检测到的piRNA簇保持较高数量.对piRNA簇来源基因进行GO分析,发现主要富集于binding功能,从中发现3个piRNA簇(簇Clu-003、簇Clu-033和簇Clu-025)与精子发生相关.这些研究结果提示piRNA簇影响香猪睾丸的发育过程.

关键词：香猪、piRNA簇、睾丸、发育机制

所属期刊栏目：56

分类号：S828.3(家畜)

资助基金：国家自然科学基金;国家高技术研究发展计划863计划课题;贵州省科技创新人才团队项目;贵州省"百"层次创新型人才培养项目;贵州省农业攻关项目;贵州大学培育项目;贵州省科技计划项目

在线出版日期：2020-10-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：141-150