基于转录组测序筛选山羊卵泡发育相关上调基因

摘要：

本研究旨在通过转录组测序筛选并研究与卵泡发育相关的上调表达基因.以3只健康的l岁龄贵州白山羊为供试对象,在其发情3d后,屠宰并采集卵巢中的优势卵泡与从属卵泡,分离颗粒细胞,转录组测序.通过生物信息学分析,并对其中的上调表达基因进行GO、KEGG信号通路分析,经实时荧光定量PCR对筛选出的上调表达基因进行验证.结果 显示:GO分析共分为三大类别44组,其中参与生物学过程(BP)的基因占72.7％,参与细胞组分(CC)的基因占13.6％,参与分子功能(MF)的基因占13.6;KEGG信号通路分析发现20条通路,其中参与核糖体通路基因富集最为显著.共筛选出4个可能促进山羊卵泡发育的基因(CALM2、TUT7、LUM和PDLIM3).荧光定量PCR结果表明,TUT7和CALM2在优势卵泡颗粒细胞中的表达量显著高于从属卵泡.本研究推测获得的2个上调表达基因可能会促进卵泡的发育,从而导致优势卵泡被选择.

关键词：山羊、上调基因、转录组测序、卵泡发育、颗粒细胞

所属期刊栏目：56

分类号：S827.2(家畜)

资助基金：贵州省教育厅青年科技人才成长项目;贵州省普通高等学校科技拔尖人才支持计划;铜仁市科技计划项目;铜仁学院博士启动基金项目;铜仁市科技计划项目

在线出版日期：2020-09-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：190-195