10.19556/j.0258-7033.20190906-07
草原红牛Bcl2L13的CDS克隆及其在不同组织的表达规律研究
本研究旨在初步探究草原红牛Bcl2L13的基因功能,并对其进行生物信息学分析,检测Bcl2L13在草原红牛不同组织中的表达差异.本实验以草原红牛为研究对象,根据GenBank公布的牛Bcl2L13基因序列(GenBank登录号:NM_001078082.2)设计引物,PCR扩增获得Bcl2L13的完整CDS并进行测序,利用分析软件进行序列同源性比对并构建系统进化树;获得对应的氨基酸序列并分析蛋白理化特性及蛋白亚细胞结构、蛋白亲疏水性和磷酸化位点;预测蛋白二级结构并进行蛋白质三级结构模型构建;采用实时荧光定量PCR方法检测Bcl2L13基因在草原红牛各组织中的表达规律.结果显示:草原红牛Bcl2L13基因核苷酸序列与普通牛和牦牛的同源性高(100％和99.3％),与瘤牛和亚洲水牛的同源性较高(91.8％、90.5％);Bcl2L13基因CDS大小为839 bp,编码279个氨基酸,该蛋白质分子式为C1348H2108N348O439S5,分子量为30.374 ku,理论等电点为4.51,蛋白质不稳定指数为77.71,总平均亲水性为-0.250.亚细胞定位分析表明,Bcl2L13蛋白分布在内质网(4.3％)、线粒体(4.3％)、过氧化物酶体(8.7％)、细胞质(65.2％)、细胞骨架(4.3％)、细胞核(13.0％);磷酸化位点分析发现Bcl2L13蛋白存在33个磷酸化位点;二级结构主要形式有α-螺旋(22.4％)、β-转角(12.1％)、β折叠(31.0％)、无规则卷曲(34.5％),与三级结构预测相同;Bcl2L13在背最长肌中表达量最高,在肺组织中表达量最少.综上,Bcl2L13基因在生物进化过程中具有低保守性,其编码的氨基酸组成的蛋白质结构不稳定,属于水溶性蛋白,主要在细胞质中发挥作用,在草原红牛不同组织的表达量有显著差异.
草原红牛、Bcl2L13基因、克隆、生物信息学分析、表达差异
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S823.2(家畜)
国家肉牛牦牛产业技术体系;国家重点研发计划;吉林省科学技术厅重点科技研发项目;肉牛肉质性状优异基因挖掘与鉴定;吉林省畜禽良种工程项目肉用草原红牛培育;吉林省农业科技创新工程高品质肉牛培育;家养动物种质资源平台;吉林省农业科学院创新工程
2020-07-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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