绵羊Wnt10b基因克隆及生物信息学分析

摘要：

Wnt10b是Wnt家族中重要成员之一,绵羊Wnt10b基因尚属未知.本研究利用RT-PCR和RACE技术克隆了绵羊Wnt10b基因的全序列,并对该基因进行了比较全面的生物信息学分析.结果表明:绵羊Wnt10b基因序列全长2321 bp,包括1116 bp的编码区序列,编码391个氨基酸;其可变剪接体Wnt10b-AS由于CDS序列部分缺失编码166个氨基酸.同源性分析发现,绵羊Wnt10b基因核苷酸和氨基酸序列与其它哺乳动物同源性较高.氨基酸序列分析发现该蛋白为亲水性不稳定蛋白,相对分子量为43.0254 kDa.预测含有6个磷酸化位点,5个豆蔻酰化位点,二级结构以无规则卷曲和α螺旋为主.生物信息学分析表明Wnt10b及Wnt10-AS均为分泌型跨膜蛋白,主要存在细胞外基质中,通过与细胞膜上受体结合,调控下游靶基因的表达.Wnt10b-AS由于缺失多个翻译后修饰位点,可能通过与主转录本不同的作用机制发挥生物学功能.本研究为进一步探讨Wnt10b基因在绵羊毛囊生长发育中的功能和作用机制奠定了信息学基础.

关键词：Wnt10b、绵羊、生物信息学分析

所属期刊栏目：52

分类号：S826.2(家畜)

资助基金：国家转基因重大专项“高产超细毛转基因羊新品种培育”2014ZX08008-001、2013ZX08008-001

在线出版日期：2016-05-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：11-15