高维生物学数据两阶段组合降维策略研究

摘要：

目的 探讨高维生物学数据的多阶段组合降维策略.方法 以微阵列数据的判别分析为例,采用实际数据和模拟数据相结合的方法,提出“初步选维→进一步降维”的两阶段组合降维策略,并与后续的“判别→验证”相结合,形成了“选维→降维→判别→验证”的判别分析思路.以后续判别分析的预测效果、预测结果的稳定性与敏感性等为指标,对2种单一降维( PCA,PLS)方法和4种组合降维方法(PCA+ SIR、PCA+SAVE、PLS+ SIR和PLS+ SAVE)进行了考察.结果 从判别模型的预测效果、预测结果的稳定性及敏感性来看,PLS优于PCA,PLS+ SIR/SAVE的组合降维效果更佳.结论 用t计分法选维,以“PLS+SIR/SAVE”法进行降维的两阶段组合降维策略,对于微阵列数据判别分析,是实用的、可行的.

关键词：两阶段组合降维、偏最小二乘、切片逆回归、切片均方误差估计、微阵列数据、判别分析

所属期刊栏目：29

分类号：O21;Q1-

资助基金：国家自然科学基金81072389,30901232;江苏省高校自然科学研究重大项目10KJA330034;江苏高校优势学科建设工程资助

在线出版日期：2013-01-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：626-629