几种差异基因分析方法及筛选效果的比较

摘要：

目的 比较六种差异基因筛选方法的使用效果及适用性.方法 用Monte-Carlo方法产生不同类型的模拟数据,分别用不同的方法计算、评价其优劣.结果 多数情况下SAM法和稳健t检验表现出了最优的筛选能力,SAM-ROC法则表现出更好的稳定性.结论 几种方法都能够有效地用于基因筛选,但各自的适应条件不同,综合看SAM法是基因筛选的首选方法,随机森林方法则具有较大的研究价值.

关键词：微阵列数据、基因筛选、Monte-Carlo模拟

所属期刊栏目：25

分类号：S88;TN6

资助基金：国家自然科学基金资助30371253;黑龙江省重点项目GB04C30202

在线出版日期：2008-10-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：354-356,362