2型糖尿病外周血长链非编码RNA‑微小RNA‑mRNA网络构建及功能富集分析

摘要：

目的 本研究通过构建长链非编码RNA(lncRNA)-微小RNA(miRNA)-mRNA网络和功能富集分析,预测参与T2DM外周血竞争性内源RNA(ceRNA)机制的关键lncRNA,以发现DM新的标志物或治疗靶点.方法 采用基因芯片技术检测T2DM外周血差异lncRNA的表达谱,采用R语言及相关生物信息学工具处理芯片数据,预测靶基因,构建lncRNA-miRNA-mRNA网络,对差异lncRNA进行KEGG通路及GO功能富集分析,并预测关键lncRNA.结果 相关性分析得到关系对2016对,包括125个lncRNA和163个mRNA.KEGG及GO分析显示有多个通路与T2DM的发生发展有联系.根据相关性分析以及软件预测数据,成功构建了lncRNA-miRNA-mRNA网络,包括21个miRNA、12个mRNA、82个lncRNA和187个相互作用关系对.预测工具筛选出6个关键lncRNA.结论 lncRNA可能通过ceRNA机制介导了DM的发生发展,其关键lncRNA可能成为未来新的DM筛查标志物或治疗靶点.

关键词：糖尿病,2型;长链非编码RNA;竞争性内源RNA;生信分析

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资助基金：江苏省预防医学科研课题;江苏省"科教强卫工程"青年医学人才项目;徐州市科技计划项目

在线出版日期：2021-09-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：675-682