基于高通量测序分析健康比格犬肠道菌群结构

摘要：

为研究健康幼龄比格犬肠道菌群结构,并进一步开展犬的肠道菌群调整试验奠定基础,本试验收集15只3月龄健康比格犬粪便,通过16SrRNA基因组测序分析肠道菌群在门、纲、目、科、属水平上的相对丰度.结果显示,比格犬肠道菌群在门水平上有6个门,相对丰度为厚壁菌门50.63％、梭杆菌门21.23％、拟杆菌门19.88％、放线菌门5.38％、变形菌门2.86％和脱铁杆菌门0.01％;在纲水平上主要有9个纲,相对丰度为梭杆菌纲29.42％、梭菌纲21.23％、拟杆菌纲19.88％、丹毒菌纲16.75％、杆菌纲4.45％、棒状杆菌纲3.89％、β-变形菌纲1.83％、放线菌纲1.49％和γ-变形杆菌纲1.01％;在目水平上主要有9个目,相对丰度为梭菌目29.42％、梭杆菌目21.23％、拟杆菌目19.88％、丹毒丝菌目16.75％、乳杆菌目4.39％、红蝽杆菌目3.89％、伯克氏菌目1.83％、双歧杆菌目1.48％和肠杆菌目0.90％;在科水平上主要有19个科,其中相对丰度前10位的分别是梭杆菌科21.23％、丹毒丝菌科16.75％、瘤胃球菌科11.99％、帕拉普氏菌科8.36％、韦荣氏球菌科7.03％、毛螺菌科6.25％、普雷沃氏菌科5.46％、S24-7科4.43％、红蝽杆菌科3.89％和乳杆菌科3.48％;在属水平上主要有30个属,其中相对丰度前10位的分别是梭杆菌属18.07％、别样棒菌属14.00％、普氏菌属13.14％、考拉杆菌属4.08％、乳杆菌属3.48％、柯林斯氏菌属2.81％、粪杆菌属2.71％、醋酸杆菌属2.22％、巨单胞菌属2.08％和劳特氏菌属2.00％.结果表明,3月龄健康比格犬已建立较为复杂的肠道菌群结构,能够用于肠道菌群调整相关试验.

关键词：比格犬、高通量测序、肠道菌群、相对丰度

所属期刊栏目：59

分类号：S852.61;S829.2(动物医学（兽医学）)

资助基金：中国特色高水平高职学校;专业建设项目;国家职业教育教师教学创新团队建设项目;江苏农牧科技职业学院校级科研项目

在线出版日期：2023-10-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：18-23