同一猪场的2株基因重组猪繁殖与呼吸综合征病毒的遗传演化分析

摘要：

为分析本实验室2017-2018年从同一规模化猪场临床病料中分离的2株猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的分子遗传特征,本试验采用PCR方法对分离毒株的全基因组进行扩增,并使用分子生物学软件Simplot 3.5.1和RDP 4.24对其进行遗传演化和重组分析.结果显示,分离毒株FJDJQ-2017和FJDJQ-2018基因组全长均为15 016 bp(去除polyA后),2个毒株之间的核苷酸相似性仅为85.8％,与代表性毒株NADC30、QYYZ、VR2332和JXA1的核苷酸同源性分别为92.7％/89.4％、82.8％/84.4％、84.9％/84.7％和 83.2％/84.5％;Nsp2 氨基酸序列分析显示,2 个毒株均存在类 NADC30 毒株特征性的(111+1+19)aa的不连续缺失;基于全基因组遗传演化分析表明,2个毒株均属于谱系1,而基于ORF5基因的进化树分析表明FJDJQ-2017属于谱系3,而FJDJQ-2018属于谱系1;重组分析结果显示,FJDJQ-2017株是以类NADC30毒株为主要亲本毒株,以类QYYZ毒株和类VR2332毒株为次要亲本毒株的重组毒株,而FJDJQ-2018株是以类NADC30毒株为主要亲本毒株,以类QYYZ毒株和类JXA1毒株为次要亲本毒株的重组毒株.本试验结果丰富了 PRRSV重组毒株的基因信息数据库,也为预防和控制猪繁殖与呼吸综合征提供了参考.

关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒、同源性分析、遗传演化、基因重组

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分类号：S855.3(动物医学（兽医学）)

资助基金：中央引导地方科技发展专项;福建省科技重大专项;福建省科技厅引导项目;奇迈基金项目;奇迈基金项目;龙岩市科技计划项目;福建省大学生创新创业计划训练项目;动物源性人畜共患防控研究中心项目

在线出版日期：2022-10-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：7-14