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高通量测序比较分析被咬犬伤口及其周边皮肤的菌群特征

引用
为了解被咬犬伤口的菌群特征及其影响因素,本试验采集10只被咬犬的伤口样品和周边皮肤样品,应用Illumi-na MiSeq高通量测序技术分析并比较两类样品的菌群结构.物种注释结果显示:巴氏杆菌、拟杆菌等厌氧菌的大量存在是咬伤伤口的特征;咬伤伤口和其周围皮肤的共同优势菌有葡萄球菌、克雷伯菌、奈瑟菌、莫拉菌、大肠埃希菌等.α多样性分析结果显示,咬伤伤口菌群的丰度和多样性较周边皮肤低;β多样性和组间群落结构差异显著性分析结果显示,咬伤伤口和周边皮肤的菌群组成大体相似,不同犬之间菌群组成存在很大个体差异.Candidatus_Saccharimonas、Conchiformibiu、[Eubac-terium]_coprostanoligenes_group、Lachnospiraceae_NK4A136_group和乳杆菌属仅存在于周边皮肤样品中.综上,犬咬伤伤口菌群以厌氧菌为主,受伤口周边皮肤菌群和攻击犬口腔菌群影响.

犬、咬伤、皮肤、高通量测序、菌群

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S858.292(动物医学(兽医学))

2023-07-24(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

共5页

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中国兽医杂志

0529-6005

11-2471/S

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2022,58(7)

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