基于转录组测序筛选高盐培养下双峰驼肾皮质细胞差异表达基因

摘要：

为探讨双峰驼的高盐适应机制并筛选出受高盐调控的基因,本试验采用RNA-Seq技术对双峰驼肾皮质细胞进行转录组测序分析.试验分为2个组,等渗培养基处理的肾皮质细胞为对照组(Control),高渗培养基处理的肾皮质细胞为高渗组(HS),进行转录组测序,从而筛选出一系列差异表达基因(DEGs),并用GO富集和KEGG富集分析对DEGs进行基因功能和途径的注释.结果显示,在高盐环境下双峰驼肾皮质细胞中共有4 854个显著DEGs;GO富集分析显示,DEGs显著富集在G蛋白偶联受体活性、受体结合、核酸结合转录因子活性、质膜、离子通道的活动和免疫反应等功能中;KEGG通路富集显示,DEGs显著富集在信号传导、辅助因子和维生素代谢、信号分子相互作用、运输和分解代谢、免疫系统等通路中;采用实时荧光定量PCR技术随机检测了参与高盐代谢的3个差异表达基因,其表达趋势与RNA-Seq 一致,可以验证RNA-Seq技术的准确性.因此,双峰驼肾皮质细胞的高盐耐受性可能与这些途径和通路中重要基因的调控有关.本试验结果将为进一步揭示双峰驼耐盐性的分子调控机制提供重要的参考依据.

关键词：高盐、双峰驼、肾皮质细胞、转录组测序、差异表达基因

所属期刊栏目：58

分类号：S852.1(动物医学（兽医学）)

资助基金：内蒙古农业大学高层次人才科研启动项目;内蒙古自治区科技计划项目

在线出版日期：2022-06-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：1-8,14